施工企業和建設單位之間協商支付工程款是一個涉及多個方面的重要過程，需要雙方充分溝通、明確各自的權利和義務，以確保工程順利進行和雙方權益得到保障。以下是從法律角度和施工實踐出發，為施工企業和建設單位之間協商支付工程款提供的一些建議：

　　一、明確工程款支付條款

　　在協商支付工程款時，雙方應首先明確工程款支付的相關條款。這包括：

　　支付金額：根據工程合同約定的總價款或單價以及實際完成的工程量，確定應支付的工程款金額。

　　支付期限：明確工程款的支付時間和節點，如預付款、進度款、結算款等的支付時間。

　　支付方式：雙方可以協商選擇直接付款至承包商指定的銀行賬戶、付款給承包商指定的負責人或團隊成員、向特定第三方支付款項等支付方式。需要注意的是，選擇向特定第三方支付款項時，應確保該第三方與工程合同有直接關聯，并明確支付條件和程序。

　　二、制定詳細的支付計劃

　　為了確保工程款的按時支付，雙方應制定詳細的支付計劃。這包括：

　　預付款計劃：在工程開始前，根據合同約定支付一定比例的預付款，以幫助施工企業啟動工程。預付款的比例和支付時間應在合同中明確約定。

　　進度款計劃：根據工程進度逐步支付工程款。雙方應約定工程進度款的支付節點和比例，如每月、每階段或每項工程完成后支付一定比例的進度款。

　　結算款計劃：工程竣工后，雙方應按照約定的合同價款及合同價款調整內容以及索賠事項進行工程竣工結算，并明確結算款的支付時間和方式。

　　三、確保支付流程的順暢

　　在協商支付工程款時，雙方還應關注支付流程的順暢性。這包括：

　　提交申請和審核：施工企業應按照約定的時間和方式向建設單位提交工程款支付申請，并附上相關證明材料。建設單位應及時審核申請材料的真實性和準確性，確保支付流程的順利進行。

　　開具發票和憑證：施工企業在收到工程款后，應及時開具發票和憑證，以證明款項的合法性和合規性。這有助于雙方建立清晰的賬務記錄，并便于日后的審計和核查。

　　解決支付糾紛：如果在支付工程款過程中出現糾紛，雙方應首先通過友好協商的方式解決。如果協商無果，可以尋求法律途徑解決爭議，如申請調解、仲裁或提起訴訟等。

　　四、注意事項

　　在協商支付工程款時，雙方還應注意以下事項：

　　遵守法律法規：雙方應嚴格遵守相關法律法規和合同約定，確保工程款的支付合法合規。

　　保護商業秘密：在協商過程中，雙方應注意保護各自的商業秘密和敏感信息，避免泄露給第三方。

　　建立信任關系：雙方應建立長期穩定的信任關系，通過及時溝通、協商解決問題等方式維護良好的合作關系。

　　五、案例分析

　　以某建筑工程項目為例，施工企業和建設單位在協商支付工程款時明確約定了以下條款：

　　預付款為合同總價的10%，在工程開工前一次性支付。

　　進度款按月支付，每月支付當月完成工程量的80%。施工企業需每月末向建設單位提交已完成工程量的報告和支付申請，建設單位在收到申請后7個工作日內完成審核并支付進度款。

　　結算款在工程竣工后3個月內支付完畢。雙方按照合同約定的價款及調整內容進行竣工結算，并扣除已支付的預付款和進度款后確定最終支付金額。

　　通過明確的條款和詳細的支付計劃，該工程項目在工程款支付方面未出現糾紛和問題，確保了工程的順利進行和雙方權益的保障。

　　綜上所述，施工企業和建設單位之間協商支付工程款需要雙方充分溝通、明確條款、制定計劃并關注支付流程的順暢性。同時，雙方還應遵守法律法規、保護商業秘密并建立信任關系，以確保工程款的支付合法合規、順利進行。